マイブログメニューの［ツール］⇒［アクセス解析］よりアクセス解析を行うことができます。このSeesaaの提供しているアクセス解析ツールでもある程度は解析を行うことができますが、アフィリエイトサイト等のアクセス解析が重要なサイトはNINJA TOOLSやAccess Analyzerといった専用ツールの使用をお勧めします。アクセス解析専用のツールなので解析方法が多彩で、またSeesaaのアクセス解析機能よりも統計が正確なようです。
アクセス解析ツールのタグを埋め込む場合はページ全体のHTML編集でHTMLの先頭または後方に埋め込むことで、全てのページへのアクセスを解析することができます。
参考までに、ブログカスタマイズのブログではAccess Analyzerを使用しています。